alterlab-rdkit - 高级 RDKit 化学信息学工具包
提供使用 RDKit 进行分子结构处理、分析、描述符计算、指纹、子结构搜索、反应、坐标生成和可视化的 Python 指导。
标签
更新于: 2026-10-07该技能可以做什么
- 读取分子结构
- 写出分子表示
- 规范化分子结构
- 检测化学问题
- 计算分子描述符
- 生成分子指纹
- 计算分子相似度
- 聚类分子化合物
- 搜索分子子结构
- 运行化学反应
- 生成二维坐标
- 生成三维坐标
- 可视化分子结构
输入
- SMILES 字符串
- SDF 文件
- MOL 文件
- MOL 数据块
- InChI 字符串
- SMARTS 模式
- 分子对象
- 反应 SMARTS
- 分子数据集
输出
- 分子对象
- SMILES 字符串
- MOL 数据块
- InChI 字符串
- 规范化结果
- 分子描述符
- 指纹数据
- 相似度分数
- 聚类结果
- 子结构匹配结果
- 反应产物
- 二维坐标
- 三维坐标
- 分子可视化结果
要求
- Python 环境
- RDKit 库