LogoClawIndex
案例技能关于
LogoClawIndex

bio-atac-seq-consensus-peakset - 构建 ATAC-seq 共识峰集

根据重复样本的 ATAC-seq 峰调用结果,通过重叠规则、峰顶重定位和固定宽度区域构建适用于差异分析的共识峰集。

标签

更新于: 2026-10-04
ATAC-seq共识峰集峰调用基因组区间差异可及性

能力

汇总重复样本峰调用按峰顶重新定位按显著性排序峰迭代移除重叠峰

典型输入

重复样本峰文件基因组大小文件峰格式和峰顶信息

典型输出

共识 BED 峰集固定宽度峰坐标峰数量摘要

该技能可以做什么

  • 汇总重复样本峰调用
  • 按峰顶重新定位
  • 按显著性排序峰
  • 迭代移除重叠峰
  • 应用多数规则重叠
  • 生成固定宽度坐标

输入

  • 重复样本峰文件
  • 基因组大小文件
  • 峰格式和峰顶信息
  • 样本或条件分组
  • 共识策略参数

输出

  • 共识 BED 峰集
  • 固定宽度峰坐标
  • 峰数量摘要

要求

  • bedtools 2.31+
  • samtools 1.19+
  • BEDOPS 2.4.41+
  • GenomicRanges 1.54+
  • DiffBind 3.12+
  • Subread 2.0+
  • pybedtools 0.10+
  • 与峰坐标匹配的基因组大小文件

来源

  • 规范: SKILL.md

ClawIndex

OpenClaw Skills 与 Use Case 索引

ClawIndex 是一个生态驱动的 OpenClaw Skills 与真实 Use Case 索引站。

索引

Skills·
Cases

Meta

关于·
声明·
邮箱·
GitHub
© 2026 ClawIndex 保留所有权利。