bio-epidemiological-genomics-phylodynamics - 时间标定系统发育与进化动力学分析
使用 TreeTime 和 BEAST2 构建时间标定系统发育树并推断进化动力学，用于疫情分析
标签
更新于: 2026-03-22能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 构建时间标定系统发育树
- 估算分歧时间
- 估算分子钟速率
- 估算祖先状态
- 分析群体动态
- 重建祖先序列
- 分析离散特征
输入
- 基因组序列比对
- 样本采集日期
- 系统发育树
- 特征状态元数据
输出
- 时间标定系统发育树
- 分子钟速率估计
- 祖先状态重建结果
- skyline 图数据
- 溯祖群体历史结果
要求
- Python 环境
- TreeTime 0.11+
- BioPython 1.83+