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bio-epitranscriptomics-m6a-peak-calling - 从MeRIP-seq数据中检测m6A峰值

通过比较MeRIP-seq的IP和input样本识别m6A修饰的RNA区域

标签

更新于: 2026-02-14
表观转录组学m6A峰值检测MeRIP-seqRNA修饰

能力

从MeRIP-seq数据中检测m6A峰值比较IP与input样本导出峰值结果

典型输入

BAM文件（IP重复）BAM文件（input重复）基因注释GTF文件

典型输出

m6A峰值BED文件峰值富集统计峰值检测结果

该技能可以做什么

  • 从MeRIP-seq数据中检测m6A峰值
  • 比较IP与input样本
  • 导出峰值结果

输入

  • BAM文件（IP重复）
  • BAM文件（input重复）
  • 基因注释GTF文件

输出

  • m6A峰值BED文件
  • 峰值富集统计
  • 峰值检测结果

要求

  • 安装exomePeak2包的R环境
  • MACS3命令行工具
  • BAM格式的MeRIP-seq数据

来源

  • 规范: SKILL.md

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