bio-fastq-quality - 分析和处理 FASTQ 质量分数
使用 Biopython 访问、分析、过滤、修剪、统计和转换 FASTQ 质量分数,并处理不同编码变体。
标签
更新于: 2026-09-29能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 访问每碱基质量分数
- 按质量过滤读段
- 修剪低质量碱基
- 计算质量分布
- 统计质量阈值
- 转换质量编码
- 判断编码限制
输入
- FASTQ 文件
- 测序元数据
- 质量阈值
- 修剪参数
输出
- 过滤后的 FASTQ 文件
- 修剪后的 FASTQ 文件
- 质量分数报告
- 按位置统计的质量分布
- 质量阈值计数
要求
- Python 环境
- Biopython 1.83 或更高版本
- 已确认的 FASTQ 质量编码
