bio-metagenomics-functional-profiling - 宏基因组功能分析工具
使用 HUMAnN3 对宏基因组进行功能谱分析，获取通路和基因家族丰度数据。
标签
更新于: 2026-03-20能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 运行 HUMAnN3
- 下载数据库
- 处理样本
- 生成基因家族
- 生成通路丰度
- 标准化表格
- 重组基因家族
- 拆分分层表
- 合并表格
- 创建条形图
- 计算通路覆盖度
输入
- 宏基因组测序数据
- 数据库文件
- 物种分类谱
- 元数据
输出
- 基因家族丰度表
- 通路丰度表
- 通路覆盖度表
- 合并表格
- 标准化表格
- 重组表格
- 条形图
- 热图
要求
- conda 或 bioconda 环境
- 数据库文件
- 计算资源