bio-pdb-structure-navigation - 导航PDB蛋白质结构层次
使用Bio.PDB导航和访问结构层次并提取序列
标签
更新于: 2026-05-28能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 解析PDB文件
- 访问结构层次
- 遍历模型
- 遍历链
- 遍历残基
- 遍历原子
- 获取原子坐标
- 提取序列
- 筛选残基
- 识别残基
- 转换残基名称
- 处理无序原子
- 统计实体数量
输入
- PDB文件
- 链ID
- 残基ID
- 原子名称
输出
- 结构模型
- 链
- 残基
- 原子
- 氨基酸序列
- 原子坐标
要求
- BioPython 1.83+
- Python