bio-phasing-imputation-haplotype-phasing - 将基因型统计定相为单倍型
使用 SHAPEIT5、SHAPEIT4、Eagle2 或 Beagle 基于群体连锁不平衡推断单倍型定相,用于填充和依赖定相的分析。
标签
更新于: 2026-10-02能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 估计单倍型定相
- 定相常见变异
- 定相罕见变异
- 拼接分块定相结果
- 评估开关错误
- 处理家系定相
输入
- 未定相基因型
- 遗传图谱
- 参考面板
- 基因组构建版本
- 家系数据
输出
- 定相单倍型
- 定相后的 BCF 或 VCF
- 开关错误指标
要求
- SHAPEIT5、Eagle2 或 Beagle
- 与构建版本匹配的遗传图谱
- 兼容的参考面板
- 已验证版本的命令行接口
