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bio-reaction-enumeration - 使用RDKit反应枚举化合物库

通过反应SMARTS转换从构建块生成虚拟化合物库,并进行产品验证。

标签

更新于: 2026-03-25
化学反应枚举RDKit组合化学分子库合成路线

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 定义反应SMARTS
  • 验证反应定义
  • 运行化学反应
  • 枚举产物组合
  • 净化分子
  • 验证产物
  • 过滤产物
  • 应用R基团模板

输入

  • 反应SMARTS字符串
  • 构建块SMILES
  • 反应物列表
  • 核心骨架SMILES
  • R基团SMILES

输出

  • 产物SMILES
  • 唯一化合物库
  • 验证的产物
  • 过滤的产物
  • 修饰的分子

要求

  • Python 3.x
  • RDKit 2024.03+

来源

  • 规范: SKILL.md
定义反应SMARTS
验证反应定义
运行化学反应
枚举产物组合
反应SMARTS字符串
构建块SMILES
反应物列表
产物SMILES
唯一化合物库
验证的产物