bio-temporal-genomics-temporal-grn - 动态基因调控网络推断
使用格兰杰因果、dynGENIE3和动态贝叶斯网络从批量时间序列表达数据推断时间延迟调控关系
标签
更新于: 2026-06-30能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 应用格兰杰因果检验
- 运行dynGENIE3推断
- 学习动态贝叶斯网络
- 过滤调控边
- 比较不同条件的网络
输入
- 时间序列表达数据
- 转录因子列表
- 时间点向量
- 候选调控因子
输出
- 调控边列表
- 网络邻接矩阵
- 边置信度分数
- 网络比较指标
要求
- Python 3.x 配备 statsmodels
- R 配备 bnlearn
- R 配备 dynGENIE3
- numpy 1.26+
- pandas 2.2+
- statsmodels 0.14+