celltypist-cell-annotation - 使用 CellTypist 注释单细胞 RNA 测序细胞
使用预训练 CellTypist 模型注释已标准化的单细胞 RNA 测序 AnnData，并返回单细胞标签、聚类共识标签和置信度分数。
标签
更新于: 2026-10-04能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 自动注释细胞
- 分配聚类共识标签
- 报告置信度分数
- 下载参考模型
- 训练自定义模型
- 可视化注释结果
输入
- 已标准化的 AnnData 对象
- CellTypist 模型
- 聚类分配结果
输出
- 已注释的 AnnData 对象
- 单细胞标签
- 聚类共识标签
- 置信度分数
- 注释可视化文件
要求
- Python 3.8 或更高版本
- celltypist 1.6 或更高版本
- scanpy 1.9 或更高版本
- anndata 软件包
- 8 GB 内存
- 下载模型所需的互联网访问