etetoolkit - 使用 ETE 进行系统发育树分析
操作和分析系统发育树，检测进化事件，整合 NCBI 分类信息，可视化树结构并评估聚类结果。
标签
更新于: 2026-10-03能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 解析系统发育树格式
- 遍历层级树结构
- 修改树拓扑
- 计算树距离
- 比较树拓扑
- 检测进化事件
- 识别直系同源和旁系同源
- 整合序列比对
- 查询 NCBI 分类信息
- 构建分类树
- 标注树节点
- 渲染树可视化结果
- 分析聚类结果
- 显示热图
输入
- 系统发育树文件
- 序列比对文件
- 物种名称
- 基因名称
- NCBI 分类数据
- 聚类数据矩阵
- 输出文件路径
输出
- 修改后的树文件
- 进化事件分类结果
- 直系同源和旁系同源分组
- 分类信息标注树
- 渲染后的树图像
- 聚类指标
- 树比较指标
- 热图可视化结果
要求
- 已安装 ETE 工具包
- 进行分类整合时可访问 NCBI 分类数据库