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fmriprep - 预处理任务态与静息态 fMRI

使用 fMRIPrep 预处理符合 BIDS 规范的任务态或静息态 fMRI 数据,并生成 BIDS-Derivatives 和受试者级 HTML 报告。

标签

更新于: 2026-10-03

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 预处理 BIDS fMRI 数据
  • 配置容器运行
  • 选择输出空间
  • 配置畸变校正
  • 提取混杂因素表
  • 重采样表面数据
  • 解读可视化报告
  • 调试流水线故障
  • 复用衍生数据
  • 生成引用文本

输入

  • BIDS 数据集
  • 输出目录
  • 工作目录
  • 受试者标签
  • 输出空间规格
  • 场图元数据
  • FreeSurfer 许可证文件
  • TemplateFlow 模板
  • 容器运行时
  • BIDS 过滤文件
  • 衍生数据集

输出

  • BIDS-Derivatives 数据集
  • 受试者级 HTML 报告
  • 混杂因素 TSV 文件
  • 表面重采样数据
  • CIFTI 输出文件
  • 流水线日志
  • 引用文本

要求

  • Python 3.10 或更高版本
  • Docker、Apptainer 或 Singularity
  • FreeSurfer 许可证
  • 兼容的 fMRIPrep 运行环境
  • TemplateFlow 访问权限或缓存模板
  • 获取未缓存资源的互联网连接

来源

  • 规范: SKILL.md
fMRI
BIDS
神经影像
预处理
fMRIPrep
Docker
Apptainer
FreeSurfer
TemplateFlow
混杂因素
预处理 BIDS fMRI 数据
配置容器运行
选择输出空间
配置畸变校正
BIDS 数据集
输出目录
工作目录
BIDS-Derivatives 数据集
受试者级 HTML 报告
混杂因素 TSV 文件