fmriprep - 预处理任务态与静息态 fMRI
使用 fMRIPrep 预处理符合 BIDS 规范的任务态或静息态 fMRI 数据,并生成 BIDS-Derivatives 和受试者级 HTML 报告。
标签
更新于: 2026-10-03能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 预处理 BIDS fMRI 数据
- 配置容器运行
- 选择输出空间
- 配置畸变校正
- 提取混杂因素表
- 重采样表面数据
- 解读可视化报告
- 调试流水线故障
- 复用衍生数据
- 生成引用文本
输入
- BIDS 数据集
- 输出目录
- 工作目录
- 受试者标签
- 输出空间规格
- 场图元数据
- FreeSurfer 许可证文件
- TemplateFlow 模板
- 容器运行时
- BIDS 过滤文件
- 衍生数据集
输出
- BIDS-Derivatives 数据集
- 受试者级 HTML 报告
- 混杂因素 TSV 文件
- 表面重采样数据
- CIFTI 输出文件
- 流水线日志
- 引用文本
要求
- Python 3.10 或更高版本
- Docker、Apptainer 或 Singularity
- FreeSurfer 许可证
- 兼容的 fMRIPrep 运行环境
- TemplateFlow 访问权限或缓存模板
- 获取未缓存资源的互联网连接
