lit-synthesizer - 检索 PubMed 和 bioRxiv 文献并生成结构化报告。
检索 PubMed 和 bioRxiv 文献，将其合成为 Markdown 报告，构建引用图谱并导出可复现性软件包。
标签
更新于: 2026-09-24能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 通过 NCBI E-utilities 检索 PubMed
- 通过 Europe PMC 检索 bioRxiv
- 提炼摘要中的重复出现主题
- 构建节点和边组成的引用图谱
- 导出可复现性软件包
- 生成结构化 Markdown 报告
输入
- 搜索查询字符串
- 输出目录路径
输出
- Markdown 综合报告
- 结构化 JSON 论文数据集
- JSON 引用图谱
- CSV 论文列表表格
- 可复现性软件包
要求
- Python >= 3.11
- biopython >= 1.83
- Linux 或 macOS 操作系统
- 用于 API 查询的网络访问权限