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案例技能关于
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molclaw-interaction-visualizer - 分析并可视化分子相互作用

分析单结构的蛋白质–配体、肽或蛋白质–蛋白质相互作用,并生成多维可视化结果及 CSV/JSON 导出文件。

标签

更新于: 2026-10-16
分子相互作用蛋白质–配体分析蛋白质–蛋白质界面肽界面结构生物学PyMOL 可视化MCP 工具

能力

分析单个结构检测九类相互作用生成二维图示渲染 PyMOL 三维视图

典型输入

复合物结构文件受体结构文件配体结构文件

典型输出

二维相互作用图PyMOL 三维渲染图残基条形图

该技能可以做什么

  • 分析单个结构
  • 检测九类相互作用
  • 生成二维图示
  • 渲染 PyMOL 三维视图
  • 创建界面热图
  • 导出 CSV 和 JSON

输入

  • 复合物结构文件
  • 受体结构文件
  • 配体结构文件
  • 伙伴蛋白结构文件
  • 分析模式
  • 链标识符
  • 配体残基名称
  • 残基编号偏移量
  • 残基功能注释
  • 对接评分
  • 配体 SMILES
  • 输出目录

输出

  • 二维相互作用图
  • PyMOL 三维渲染图
  • 残基条形图
  • 界面热图
  • 界面网络图
  • 伙伴位点 CSV 文件
  • 相互作用 CSV 文件
  • 决策就绪的 JSON 文件

要求

  • MolClaw MCP interaction_visualizer 工具或本地 CLI
  • Python 和 NumPy 运行环境
  • MCP 调用所需的服务器端输入路径
  • 使用 molclaw-file-transfer 上传本地文件
  • 生成三维渲染所需的 PyMOL

来源

  • 规范: SKILL.md

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