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omero-integration - OMERO显微镜数据管理

通过OMERO Python API访问和管理显微镜图像及数据

标签

更新于: 2026-05-09

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 连接到OMERO服务器
  • 管理连接会话
  • 列出项目
  • 检索数据集
  • 访问图像
  • 查询筛选数据
  • 添加标签
  • 创建注释
  • 附加文件
  • 设置元数据
  • 提取像素数据
  • 生成缩略图
  • 创建投影
  • 修改渲染设置
  • 创建ROI
  • 绘制ROI形状
  • 分析强度
  • 导出ROI坐标
  • 存储测量结果
  • 创建表

输入

  • OMERO服务器凭证
  • OMERO服务器主机
  • OMERO服务器端口
  • 会话ID
  • 项目ID
  • 数据集ID
  • 图像ID
  • 筛选数据
  • ROI坐标
  • 注释文件

输出

  • 项目列表
  • 数据集列表
  • 图像数据
  • 像素数组
  • 缩略图
  • ROI形状
  • 强度测量
  • OMERO表
  • 注释数据
  • 派生图像
  • 分析结果

要求

  • Python 3.7+
  • Zeroc Ice 3.6+
  • OMERO服务器访问
  • omero-py库

来源

  • 规范: SKILL.md
显微镜
图像分析
数据管理
OMERO
Python API
批量处理
ROI分析
高通量筛选
连接到OMERO服务器
管理连接会话
列出项目
检索数据集
OMERO服务器凭证
OMERO服务器主机
OMERO服务器端口
项目列表
数据集列表
图像数据