proteomics-de - 无标记定量蛋白质组学差异表达分析
分析MaxQuant和DIA-NN输出的无标记定量蛋白质组学数据，包括预处理、缺失值填充和统计检验
标签
更新于: 2026-03-23能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 过滤MaxQuant蛋白组
- 提取DIA-NN蛋白标识符
- 转换LFQ强度值
- 填充缺失值
- 执行t检验
- 计算FDR校正
- 生成PCA图
- 生成火山图
- 创建markdown报告
输入
- MaxQuant蛋白组文件
- DIA-NN输出文件
- 样本元数据CSV
- 分析参数
输出
- 差异表达结果表
- 填充后蛋白组表
- PCA图
- 火山图
- 填充分布图
- markdown报告
要求
- Python3
- pandas
- numpy
- matplotlib
- scikit-learn
- scipy
- seaborn