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proteomics-de - 蛋白质差异丰度检验

实验条件间差异丰度蛋白质的统计检验

标签

更新于: 2026-03-20
蛋白质组学统计分析MSstatslimmaproDA可视化

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 执行MSstats比较
  • 运行limma t检验
  • 处理缺失值
  • 运行scipy t检验
  • 生成火山图
  • 创建热图

输入

  • 蛋白质矩阵CSV文件
  • 比较矩阵
  • 条件组别
  • FDR阈值
  • FC阈值

输出

  • 差异结果表格
  • 统计CSV文件
  • 火山图图像
  • 分析报告
  • 结果JSON文件

要求

  • Python环境
  • R包 (MSstats, limma, proDA)
  • numpy
  • pandas
  • scipy
  • statsmodels

来源

  • 规范: SKILL.md
执行MSstats比较
运行limma t检验
处理缺失值
运行scipy t检验
蛋白质矩阵CSV文件
比较矩阵
条件组别
差异结果表格
统计CSV文件
火山图图像