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rdkit - RDKit 化学信息学工具包

解析和操作分子结构,计算描述符,生成指纹与坐标,搜索子结构,运行反应并评估相似性。

标签

更新于: 2026-10-06

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 解析分子结构
  • 写出分子结构
  • 分子结构清洗
  • 检测化学问题
  • 分析分子结构
  • 计算分子描述符
  • 生成分子指纹
  • 计算分子相似性
  • 搜索分子子结构
  • 运行化学反应
  • 生成二维坐标
  • 生成三维坐标
  • 可视化分子

输入

  • 分子结构文件
  • SMILES 字符串
  • InChI 字符串
  • MOL 块
  • 分子对象
  • SMARTS 模式
  • 反应 SMARTS
  • 相似性参数

输出

  • 分子结构表示
  • 经过验证的分子对象
  • 分子描述符
  • 分子指纹
  • 相似性分数
  • 子结构匹配结果
  • 反应产物
  • 二维坐标
  • 三维坐标
  • 分子可视化结果

要求

  • Python 环境
  • RDKit 库

来源

  • 规范: SKILL.md
化学信息学
分子分析
化学结构
分子描述符
分子指纹
子结构搜索
化学反应
计算化学
解析分子结构
写出分子结构
分子结构清洗
检测化学问题
分子结构文件
SMILES 字符串
InChI 字符串
分子结构表示
经过验证的分子对象
分子描述符