rdkit - 使用 RDKit 分析和处理分子
通过 Python API 解析、分析、搜索、比较、可视化和转换分子结构及化学反应。
标签
更新于: 2026-10-07该技能可以做什么
- 解析分子结构
- 写出分子表示
- 清理并验证分子
- 计算分子描述符
- 生成分子指纹
- 计算分子相似度
- 搜索分子子结构
- 生成化学反应
- 生成二维和三维坐标
- 分析立体化学和片段
- 可视化分子
输入
- 分子结构
- SMILES、SDF、MOL 和 InChI 数据
- SMARTS 查询
- 反应 SMARTS
- 分子数据集
输出
- 解析后的分子对象
- 分子表示
- 计算得到的描述符
- 分子指纹
- 相似度分数
- 子结构匹配结果
- 反应产物
- 二维和三维坐标
- 分子可视化结果
- 验证消息
要求
- Python 运行环境
- RDKit 库