sc-qc - 单细胞质控指标计算与可视化
为单细胞RNA测序数据计算质控指标并生成诊断图
标签
更新于: 2026-03-26能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 计算质控指标
- 加载AnnData对象
- 生成小提琴图
- 生成散点图
- 生成直方图
- 识别高表达基因
- 导出质控指标
- 生成markdown报告
输入
- AnnData文件
- 输出目录
- 物种参数
输出
- 质控指标CSV文件
- 质控可视化图
- 质控总结报告
- 带质控指标的AnnData
- 质控指标JSON文件
要求
- Python 3环境
- scanpy库
- numpy库
- pandas库
- matplotlib库
- seaborn库