servalcat - 冷冻电镜单颗粒倒易空间精修工具
为冷冻电镜单颗粒分析和晶体学执行倒易空间精修和图谱计算
标签
更新于: 2026-05-09能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 对半图谱精修模型
- 计算Fo-Fc差值图
- 计算省略图
- 裁剪图谱文件
- 展开NCS对称性
- 查找图谱峰
- 转换FSC JSON为CSV
- 精修晶体学模型
输入
- PDB模型文件
- mmCIF模型文件
- 半图谱文件
- 分辨率值
- 掩膜文件
- 配体约束字典
- 点群对称性
- 螺旋对称性参数
- 关键词约束文件
输出
- 精修PDB模型
- 精修mmCIF模型
- 对称性展开模型
- Fo-Fc图谱文件
- 归一化Fo-Fc图谱
- FSC曲线日志
- Coot脚本
要求
- 未锐化半图谱
- Python环境
- pip或CCP4 v9.0+