simo-multiomics-integration-agent - 多组学空间整合
使用概率对齐进行多组学数据集的空间整合
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更新于: 2026-03-20能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 整合空间转录组数据
- 投影单细胞ATAC-seq图谱
- 映射甲基化数据
- 合并多模态数据
- 分配细胞类型
- 识别细胞微环境
- 映射细胞状态
- 归一化数据集
- 选择特征
- 计算分配概率
- 转移模态
- 创建可视化
- 估计不确定性
- 执行批次校正
输入
- 空间转录组数据
- 单细胞RNA测序数据
- 单细胞ATAC-seq数据
- 甲基化数据
- 蛋白质组学数据
- 空间参考数据
输出
- 整合空间对象
- 细胞类型图谱
- 染色质可及性图谱
- 微环境分配
- 不确定性图谱
要求
- Python 3.10+