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案例技能关于
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universal-single-cell-annotator - 通用单细胞RNA-seq数据注释器

使用标记基因、深度学习(CellTypist)或大语言模型注释单细胞RNA-seq数据的统一接口

标签

更新于: 2026-02-12
基因组学单细胞分析细胞类型注释生物信息学

能力

使用标记基因对细胞评分通过CellTypist转移标签使用LLM解释细胞群

典型输入

单细胞RNA-seq数据标记基因列表CellTypist模型

典型输出

注释的细胞类型标签更新的AnnData对象

该技能可以做什么

  • 使用标记基因对细胞评分
  • 通过CellTypist转移标签
  • 使用LLM解释细胞群

输入

  • 单细胞RNA-seq数据
  • 标记基因列表
  • CellTypist模型
  • LLM访问权限

输出

  • 注释的细胞类型标签
  • 更新的AnnData对象

要求

  • Python 3.9+环境
  • Scanpy库
  • 可选的CellTypist库

来源

  • 规范: SKILL.md

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