universal-single-cell-annotator - 通用单细胞RNA-seq数据注释器
使用标记基因、深度学习(CellTypist)或大语言模型注释单细胞RNA-seq数据的统一接口
标签
更新于: 2026-02-12该技能可以做什么
- 使用标记基因对细胞评分
- 通过CellTypist转移标签
- 使用LLM解释细胞群
输入
- 单细胞RNA-seq数据
- 标记基因列表
- CellTypist模型
- LLM访问权限
输出
- 注释的细胞类型标签
- 更新的AnnData对象
要求
- Python 3.9+环境
- Scanpy库
- 可选的CellTypist库
