bio-genome-intervals-coverage-analysis - 计算基因组区间的测序深度与覆盖度
使用 bedtools 计算基因组区间的读取深度与覆盖度,生成 bedGraph 文件,计算逐碱基深度并汇总统计数据。
标签
更新于: 2026-09-19能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 生成 bedGraph 文件
- 计算逐碱基覆盖深度
- 计算特征覆盖度统计数据
- 跨多个 BAM 统计读取数
输入
- BAM 比对文件
- BED 区间文件
- 基因组大小文件
输出
- bedGraph 文件
- 覆盖度汇总文件
- 覆盖度直方图文件
要求
- bedtools 2.31+
- samtools 1.19+
- numpy 1.26+
- pandas 2.2+
