bio-imaging-mass-cytometry-data-preprocessing - IMC数据预处理
使用steinbock和Python加载并预处理成像质谱细胞术数据，进行热像素移除和图像归一化。
标签
更新于: 2026-03-26能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 加载MCD文件
- 转换MCD为TIFF
- 移除热像素
- 应用溢出校正
- 归一化图像
- 转换数据
输入
- MCD文件
- 面板CSV文件
- 溢出矩阵文件
- Ilastik项目文件
输出
- TIFF图像
- 概率图
- 归一化图像
要求
- Python 3.x
- steinbock 0.16+
- anndata 0.10+
- numpy 1.26+
- pandas 2.2+
- scanpy 1.10+
- scipy 1.12+