bio-longread-qc - 长读长测序质量控制工具
使用 NanoPlot、NanoStat 和 chopper 对长读长测序数据进行质量控制
标签
更新于: 2026-03-21能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 生成读长分布图
- 创建质量得分图
- 计算汇总统计信息
- 按长度过滤序列
- 按质量过滤序列
- 切除接头序列
- 生成质控报告
- 可视化序列特征
输入
- FASTQ 文件
- BAM 文件
- 测序摘要文件
- 质量阈值
- 长度阈值
输出
- 质控报告
- 统计文件
- 图表文件
- 过滤后的 FASTQ 文件
- HTML 报告
要求
- BioPython 1.83+
- numpy 1.26+
- NanoPlot
- NanoStat
- chopper