bio-metabolomics-xcms-preprocessing - 用 XCMS 预处理非靶向 LC-MS 数据
使用 R 和 xcms 4.x 提取 LC-MS 特征，包括峰检测、保留时间校准、分组、缺失峰填充、冗余合并和 QC 过滤。
标签
更新于: 2026-10-06能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 读取质心化 mzML 文件
- 检测色谱峰
- 校准保留时间
- 分组对应峰
- 填充缺失峰面积
- 合并特征冗余
- 应用 QC 特征过滤
输入
- 质心化 mzML 文件
- 样本元数据
- 仪器参数
- 色谱参数
- XCMS 处理参数
输出
- 特征-样本矩阵
- 处理后的 XcmsExperiment 对象
- 保留时间校准结果
- 特征定义
- 冗余分组注释
要求
- R 运行环境
- xcms 4.x 或更高版本
- Spectra 1.12 或更高版本
- CAMERA 1.58 或更高版本
- 质心化 LC-MS 数据