bio-metagenomics-functional-profiling - 使用HUMAnN3进行宏基因组功能分析
使用HUMAnN3分析宏基因组样本的功能潜力，获取通路丰度和基因家族信息
标签
更新于: 2026-03-20能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 分析宏基因组样本
- 计算通路丰度
- 统计基因家族
- 标准化丰度数据
- 重分组基因家族
- 拆分层化表格
- 生成质量报告
- 可视化通路数据
- 处理多个样本
- 合并样本表格
输入
- 宏基因组fastq文件
- 物种谱文件
- ChocoPhlAn数据库
- UniRef数据库
- 元数据文件
输出
- 基因家族丰度表
- 通路丰度表
- 通路覆盖率表
- 标准化丰度表
- 重分组基因表
- 质量控制报告
- 通路热图
- 批量处理结果
要求
- conda环境
- 安装HUMAnN3
- ChocoPhlAn数据库
- UniRef数据库