bio-pathway-gsea - 基因集富集分析工具
使用clusterProfiler对排序基因列表执行GSEA,无需任意阈值即可检测协同表达变化。
标签
更新于: 2026-03-19能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 运行GSEA分析
- 执行GO富集
- 执行KEGG富集
- 分析自定义基因集
- 读取GMT文件
- 导出分析结果
输入
- 差异表达结果
- 排序基因列表
- 物种数据库
- GMT文件
- MSigDB基因集
输出
- GSEA结果
- 富集分数
- p值
- 核心富集基因
- CSV文件
要求
- R环境
- clusterProfiler包
- 物种数据库
- 基因ID映射
