bio-pdb-structure-navigation - 导航 PDB 结构层级
使用 Biopython Bio.PDB SMCRA 模型导航蛋白质结构层级，访问模型、链、残基和原子
标签
更新于: 2026-05-28能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 解析 PDB 文件
- 访问结构模型
- 访问结构链
- 访问结构残基
- 访问结构原子
- 遍历模型
- 遍历链
- 遍历残基
- 遍历原子
- 获取原子坐标
- 获取原子属性
- 提取多肽序列
- 按类型过滤残基
- 按名称过滤原子
- 处理无序原子
- 处理无序残基
- 统计结构实体
- 导航父实体
- 转换残基名称
输入
- PDB 文件
- 残基标识符
- 链标识符
- 原子名称
- 残基类型
输出
- 结构对象
- 模型对象
- 链对象
- 残基对象
- 原子对象
- 原子坐标
- 多肽序列
- 残基名称转换
要求
- BioPython 1.83+
- Python 环境