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bio-phylo-tree-io - Biopython系统发生树读写工具

读取、写入和转换Newick、Nexus、PhyloXML和NeXML格式的系统发生树文件

标签

更新于: 2026-03-20
系统发生学树生物信息学文件格式NewickNexusPhyloXML

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 读取树文件
  • 写入树文件
  • 解析树格式
  • 转换树格式
  • 序列化树字符串
  • 验证树格式
  • 处理多个树
  • 迭代树文件
  • 查找树枝系
  • 获取树终端节点
  • 获取分支长度

输入

  • Newick树文件
  • Nexus树文件
  • PhyloXML树文件
  • NeXML树文件
  • Newick字符串
  • 树仓库

输出

  • 树文件
  • 树字符串
  • 树结构
  • ASCII树图
  • 树数量

要求

  • Python 3
  • Biopython库

来源

  • 规范: SKILL.md
读取树文件
写入树文件
解析树格式
转换树格式
Newick树文件
Nexus树文件
PhyloXML树文件
树文件
树字符串
树结构