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bio-spatial-transcriptomics-spatial-domains - 转录组学数据空间域检测

使用表达和空间聚类方法识别空间区域和组织区域

标签

更新于: 2026-03-20
空间转录组学聚类生物信息学Squidpy区域检测

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 构建空间邻域图
  • 运行Leiden聚类
  • 结合表达和空间图
  • 检测空间区域
  • 评估聚类质量
  • 发现标记基因
  • 标注组织区域

输入

  • 空间转录组学数据
  • 空间坐标

输出

  • 空间区域分配
  • 区域标记基因
  • 聚类评估分数

要求

  • Python环境
  • Squidpy
  • Scanpy

来源

  • 规范: SKILL.md

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