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bio-spatial-transcriptomics-spatial-domains - 空间转录组学空间域检测

通过结合表达和空间信息聚类，识别空间转录组学数据中的空间域和组织区域

标签

更新于: 2026-03-20
空间转录组学空间聚类空间域检测SquidpyScanpy

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 构建空间邻接关系
  • 运行Leiden聚类
  • 可视化空间聚类

输入

  • 空间转录组学数据
  • 基因表达矩阵
  • 空间坐标

输出

  • 空间聚类分配
  • 空间域边界可视化

要求

  • Python环境
  • Squidpy库
  • Scanpy库

来源

  • 规范: SKILL.md

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