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  • anndata - 管理AnnData对象
    单细胞RNA测序生物信息学基因组学数据处理

    ★ 399 · 更新于 2026-06-30

    管理AnnData对象用于单细胞基因组和生物学数据集

    ⚙ 创建AnnData对象⚙ 读取h5ad文件⚙ 写入h5ad文件
  • bio-spatial-transcriptomics-spatial-domains - 空间转录组空间域检测
    空间转录组聚类空间域生物信息学

    ★ 60 · 更新于 2026-03-20

    使用表达和空间上下文聚类识别空间域和组织区域

    ⚙ 构建空间邻域图⚙ 执行Leiden聚类⚙ 合并表达图
  • bio-spatial-transcriptomics-spatial-domains - 空间转录组学空间域检测
    空间转录组学空间聚类空间域检测Squidpy

    ★ 18 · 更新于 2026-03-20

    通过结合表达和空间信息聚类，识别空间转录组学数据中的空间域和组织区域

    ⚙ 构建空间邻接关系⚙ 运行Leiden聚类⚙ 可视化空间聚类