bio-workflows-multi-omics-pipeline - 多组学集成分析流程
使用 MOFA2、mixOmics 和 SNF 对转录组、蛋白质组和代谢组进行数据协调、多组学集成与下游分析。
标签
更新于: 2026-09-24能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 跨模态匹配样本
- 筛选高变特征
- 训练 MOFA2 多组学模型
- 执行 mixOmics DIABLO 集成
- 使用 SNF 融合网络
- 解释因子与特征权重
- 进行 GO 富集分析
- 开展生存分析
输入
- RNA-seq 归一化数据文件
- 蛋白质组学归一化数据文件
- 代谢组学归一化数据文件
- 样本元数据文件
输出
- MOFA 模型文件
- 可视化图表文件
- CSV 因子值与权重文件
要求
- R 运行环境
- MOFA2 程序包
- mixOmics 程序包
- SNFtool 程序包
- clusterProfiler 程序包
- survival 程序包