bio-workflows-multi-omics-pipeline - 垂直批量多组学整合工作流
通过样本协调、方法选择、结果解释和留出队列验证,编排垂直批量多组学整合。
标签
更新于: 2026-10-16能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 确认垂直样本对应关系
- 按稳定主键连接样本
- 分别规范化各组学
- 均衡各视图方差
- 路由至 MOFA2、DIABLO 或 SNF
- 解释因子和特征
- 在留出队列中验证
输入
- 批量 RNA 数据
- 蛋白质数据
- 甲基化数据
- 稳定样本主键
- 样本元数据
- 整合目标
- 留出队列
- 已安装的 R 软件包
输出
- 整合潜在因子
- 预测特征
- 患者亚型
- 各视图方差解释表
- 因子和特征解释结果
- 留出队列验证结果
要求
- R 环境
- 兼容的 MOFA2、mixOmics 和 SNFtool 版本
- 多组学整合组件技能
