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bio-workflows-multi-omics-pipeline - 垂直批量多组学整合工作流

通过样本协调、方法选择、结果解释和留出队列验证,编排垂直批量多组学整合。

标签

更新于: 2026-10-16

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 确认垂直样本对应关系
  • 按稳定主键连接样本
  • 分别规范化各组学
  • 均衡各视图方差
  • 路由至 MOFA2、DIABLO 或 SNF
  • 解释因子和特征
  • 在留出队列中验证

输入

  • 批量 RNA 数据
  • 蛋白质数据
  • 甲基化数据
  • 稳定样本主键
  • 样本元数据
  • 整合目标
  • 留出队列
  • 已安装的 R 软件包

输出

  • 整合潜在因子
  • 预测特征
  • 患者亚型
  • 各视图方差解释表
  • 因子和特征解释结果
  • 留出队列验证结果

要求

  • R 环境
  • 兼容的 MOFA2、mixOmics 和 SNFtool 版本
  • 多组学整合组件技能

来源

  • 规范: SKILL.md
多组学
垂直整合
MOFA2
mixOmics
DIABLO
SNF
生物信息学
R
确认垂直样本对应关系
按稳定主键连接样本
分别规范化各组学
均衡各视图方差
批量 RNA 数据
蛋白质数据
甲基化数据
整合潜在因子
预测特征
患者亚型