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esm - 用于ESM3蛋白质生成设计与ESM C嵌入的工具包。

提供蛋白质语言模型,支持跨序列、结构与功能的蛋白质生成设计以及蛋白质嵌入提取。

标签

更新于: 2026-09-24
蛋白质设计ESM3ESM-C蛋白质嵌入逆向折叠生物信息学

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 生成蛋白质序列
  • 预测蛋白质三维结构
  • 进行结构逆向折叠设计
  • 提取蛋白质嵌入表示
  • 根据功能标注条件生成
  • 使用思维链精炼蛋白质设计
  • 通过Forge执行批处理推理

输入

  • 蛋白质序列
  • PDB结构文件
  • 功能标注
  • Forge API令牌

输出

  • 生成的蛋白质序列
  • PDB结构字符串
  • 三维坐标数据
  • 蛋白质嵌入张量

要求

  • Python esm依赖包
  • 支持CUDA的GPU
  • 云端模型所需Forge API令牌

来源

  • 规范: SKILL.md
生成蛋白质序列
预测蛋白质三维结构
进行结构逆向折叠设计
提取蛋白质嵌入表示
蛋白质序列
PDB结构文件
功能标注
生成的蛋白质序列
PDB结构字符串
三维坐标数据