geo-database - 搜索和获取 NCBI GEO 基因组学数据
搜索 NCBI GEO 中的基因表达和功能基因组学数据集，获取元数据与表达数据，并下载相关文件。
标签
更新于: 2026-10-19能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 搜索 GEO 数据集
- 搜索基因表达谱
- 获取 GEO 元数据
- 下载 GEO 数据集
- 解析 GEO 系列
- 提取表达矩阵
- 按元数据筛选样本
- 获取补充文件
输入
- GEO 搜索查询
- GEO 登录号
- 基因名称
- 物种名称
- 实验条件
- 下载目录
- NCBI Entrez 电子邮箱
输出
- 搜索结果记录
- GEO 元数据
- 表达矩阵
- 下载的 GEO 文件
- 筛选后的样本子集
- 表达谱记录
要求
- 互联网访问
- Python 环境
- GEOparse 库
- Biopython 库
- NCBI Entrez 电子邮箱