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ion-to-molecule-relationship-mapping - 构建 LC-MS 离子与预测分子的二分网络图

将预测分子与亲本离子构建为二分网络图,导出供 Cytoscape 可视化的网络文件。

标签

更新于: 2026-09-18
代谢组学液质联用二分网络cytoscapemolnotator

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 构建二分网络图
  • 分配分子与离子属性
  • 导出网络与表格文件

输入

  • 去重分子数据表
  • 离子元数据表
  • 余弦相似度聚类结果
  • 分子预测与离子关联数据

输出

  • GraphML 或 GML 网络文件
  • 节点 CSV 表格
  • 边 CSV 表格
  • Cytoscape 兼容网络文件

要求

  • Python 环境
  • MolNotator 函数库
  • Cytoscape 软件

来源

  • 规范: SKILL.md

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