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案例技能关于
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metabolite-feature-clustering-by-retention-time - 基于保留时间的代谢物特征聚类

依据保留时间相似性和跨样本强度相关性模式,将源自同种代谢物的质谱特征进行聚类整合。

标签

更新于: 2026-09-21

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 聚类质谱特征
  • 计算保留时间相似度
  • 计算样本强度相关性
  • 执行层级树图剪枝
  • 推导代谢物分子量
  • 导出MSP质谱文件

输入

  • XCMS xcmsSet对象
  • 特征强度矩阵
  • 实验设计元数据

输出

  • RC对象
  • SpecAbund矩阵
  • MSP光谱文件
  • 聚类注释信息

要求

  • R环境
  • RAMClustR包
  • XCMS包
  • dynamicTreeCut包
  • InterpretMSSpectrum包

来源

  • 规范: SKILL.md

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