metabolite-feature-clustering-by-retention-time - 基于保留时间的代谢物特征聚类
依据保留时间相似性和跨样本强度相关性模式,将源自同种代谢物的质谱特征进行聚类整合。
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更新于: 2026-09-21能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 聚类质谱特征
- 计算保留时间相似度
- 计算样本强度相关性
- 执行层级树图剪枝
- 推导代谢物分子量
- 导出MSP质谱文件
输入
- XCMS xcmsSet对象
- 特征强度矩阵
- 实验设计元数据
输出
- RC对象
- SpecAbund矩阵
- MSP光谱文件
- 聚类注释信息
要求
- R环境
- RAMClustR包
- XCMS包
- dynamicTreeCut包
- InterpretMSSpectrum包
