metabolomics-msdial-preprocessing - 使用 MS-DIAL 进行液相色谱-质谱代谢组学数据预处理
使用 MS-DIAL 进行液相色谱-质谱代谢组学数据预处理，涵盖峰检测、对齐、注释、过滤及导出至 R 和 Python。
标签
更新于: 2026-09-21能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 检测色谱峰
- 跨样本对齐色谱峰
- 结合数据库注释代谢物
- 按置信度过滤特征
- 导出结果供下游分析
- 运行 MS-DIAL 命令行批处理
- 归一化响应强度矩阵
输入
- LC-MS 原始数据文件
- MS-DIAL 对齐结果 CSV 文件
- MS-DIAL 参数文件
- 参考 MSP 数据库文件
- 样本元数据文件
输出
- 过滤后的特征强度矩阵
- 预处理后的 CSV 数据文件
- SummarizedExperiment R 对象
- MetaboAnalyst 兼容 CSV 文件
要求
- MS-DIAL 软件或 MsdialConsoleApp.exe
- Windows 操作系统（命令行模式）
- Python (numpy 1.26+, pandas 2.2+)
- R (tidyverse, SummarizedExperiment)