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natural-product-classifier-substitution - 在 ConCISE 中使用 NPClassifier 替换 ClassyFire

在 GNPS 无法提供 ClassyFire 数据时,于 ConCISE 中改用 NPClassifier 进行天然产物共识分类。

标签

更新于: 2026-09-20

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 在 ConCISE 中启用 NPClassifier 模式
  • 从结构标注导出 NPClassifier 分类本体
  • 生成天然产物共识分类结果文件
  • 计算各分类层级的共识置信度指标

输入

  • GNPS 任务 ID 或光谱库匹配文件
  • CANOPUS 预测文件 canopus_summary.tsv
  • GNPS 特征分子网络文件 Node_info.tsv

输出

  • 包含 NPClassifier 本体的共识分类文件
  • 各层级分类共识度置信指标

要求

  • 带有 ConCISE CLI 或 GUI 的 Python 3 环境
  • 包含 SMILES 或 InChIKey 的输入结构标注

来源

  • 规范: SKILL.md

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