pdb-database - 访问RCSB PDB蛋白质与核酸三维结构数据库
从RCSB PDB搜索、检索和下载生物大分子三维结构及元数据,用于结构生物学与药物发现研究。
标签
更新于: 2026-06-30能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 按文本搜索结构
- 按属性搜索结构
- 按序列相似性搜索
- 按结构相似性搜索
- 检索结构条目数据
- 下载PDB坐标文件
- 下载mmCIF坐标文件
- 获取结构元数据
- 批量查询多个结构
- 执行GraphQL查询
输入
- PDB条目ID
- 搜索关键词
- 蛋白质或核酸序列
- 查询参数
- GraphQL查询语句
输出
- 结构坐标文件
- 结构元数据记录
- 搜索结果列表
- 条目信息数据
要求
- rcsb-api Python包
- RCSB PDB服务器网络访问
- BioPython库用于结构解析(可选)
