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案例技能关于
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Proteomics - 无标记定量蛋白质组学分析工具包

使用R脚本分析无标记定量蛋白质组学数据,进行归一化、可视化、通路分析和蛋白质列表交叉引用

标签

更新于: 2026-02-11

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 归一化蛋白质数据
  • 创建火山图
  • 生成热图
  • 运行PCA分析
  • 进行通路富集分析
  • 查询蛋白质列表
  • 创建Excel报告
  • 分析基质体蛋白质
  • 识别SASP因子

输入

  • 蛋白质强度数据
  • 样本元数据
  • 比较结果
  • q值阈值
  • 倍变阈值
  • 生物体规格
  • 参考蛋白质列表
  • R脚本目录
  • 项目工作目录

输出

  • TIFF图表文件
  • Excel报告表格
  • 通路分析结果
  • 蛋白质列表匹配结果
  • 归一化数据文件
  • 样本相关性图
  • 火山图图像
  • 热图可视化

要求

  • 已安装R环境
  • 特定目录结构
  • 参考数据文件可用
  • 设置项目工作目录
  • 数据/子目录包含输入文件
  • 输出/子目录存储结果
  • 可访问Proteomics技能目录

来源

  • 规范: SKILL.md

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