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pyopenms - 面向质谱数据分析的 Python 接口

PyOpenMS 提供 OpenMS 的 Python 接口,用于蛋白质组学和代谢组学质谱数据的处理、特征检测与鉴定。

标签

更新于: 2026-09-16
质谱分析蛋白质组学代谢组学pyopenmspython

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 加载质谱数据文件格式
  • 处理质谱原始光谱数据
  • 检测并关联光谱特征
  • 使用假阳性率过滤鉴定结果
  • 跨样品校准保留时间
  • 导出特征图谱至 Pandas 数据帧

输入

  • 质谱数据文件
  • 鉴定结果文件
  • 算法配置参数

输出

  • 处理后的质谱实验数据
  • 检测出的特征图谱
  • 过滤后的鉴定结果
  • Pandas 数据帧

要求

  • Python 运行环境
  • pyopenms 软件包

来源

  • 规范: SKILL.md
加载质谱数据文件格式
处理质谱原始光谱数据
检测并关联光谱特征
使用假阳性率过滤鉴定结果
质谱数据文件
鉴定结果文件
算法配置参数
处理后的质谱实验数据
检测出的特征图谱
过滤后的鉴定结果