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r-reproducibility-guide - 在 R 中创建可复现的研究工作流

指导使用 RMarkdown、Quarto、renv 包管理和自动化流水线在 R 中创建可复现的研究工作流。

标签

更新于: 2026-09-16

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 组织项目目录结构
  • 使用 renv 管理包版本
  • 使用 RMarkdown 和 Quarto 创建报告
  • 使用 Makefile 自动化构建流水线
  • 使用 targets 跟踪执行依赖

输入

  • 原始研究数据文件
  • R 分析脚本
  • RMarkdown 与 Quarto 源文件
  • renv 锁定文件

输出

  • 处理后的数据集
  • 编译后的文档与报告
  • 生成的图表
  • renv 锁定文件

要求

  • R 语言环境
  • renv R 包
  • RMarkdown 或 Quarto CLI

来源

  • 规范: SKILL.md
R 编程
RMarkdown
Quarto
renv
可复现性
计算可复现性
组织项目目录结构
使用 renv 管理包版本
使用 RMarkdown 和 Quarto 创建报告
使用 Makefile 自动化构建流水线
原始研究数据文件
R 分析脚本
RMarkdown 与 Quarto 源文件
处理后的数据集
编译后的文档与报告
生成的图表