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reactome-database - 查询Reactome通路数据库

查询Reactome REST API进行通路分析、基因-通路映射和分子相互作用

标签

更新于: 2026-03-25
通路分析生物信息学分子相互作用系统生物学基因富集

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 查询数据库版本
  • 检索通路信息
  • 查询特定实体
  • 获取参与分子
  • 执行超表达分析
  • 分析表达数据
  • 映射基因到通路
  • 投影物种标识符
  • 构建可视化URL

输入

  • 基因标识符
  • 蛋白质标识符
  • 表达数据TSV
  • 通路ID
  • 实体ID

输出

  • 通路数据
  • 富集通路
  • 统计指标
  • 分析令牌
  • 可视化URL

要求

  • 网络连接
  • HTTP请求支持

来源

  • 规范: SKILL.md
查询数据库版本
检索通路信息
查询特定实体
获取参与分子
基因标识符
蛋白质标识符
表达数据TSV
通路数据
富集通路
统计指标