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rippp-candidate-structure-generation - 生成 RiPP 前体肽的拟议翻译后修饰变体

根据类别修饰规则枚举 RiPP 前体肽的翻译后修饰变体,构建用于下游谱图匹配的结构数据库。

标签

更新于: 2026-09-20
代谢组学核糖体合成和翻译后修饰肽质谱基因组挖掘

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 枚举前体肽的 PTM 变体
  • 构建特定类别的 RiPP 结构数据库
  • 映射前体元数据与候选结构

输入

  • 前体肽序列
  • RiPP 类别标签
  • 特定类别的修饰规则集

输出

  • 按类别划分的 RiPP 结构数据库文件
  • 带有 PTM 注释的已枚举候选结构
  • 前体与结构映射元数据

要求

  • MetaMiner 或 NPDtools 2.5.0
  • Python 运行环境

来源

  • 规范: SKILL.md
枚举前体肽的 PTM 变体
构建特定类别的 RiPP 结构数据库
映射前体元数据与候选结构
前体肽序列
RiPP 类别标签
特定类别的修饰规则集
按类别划分的 RiPP 结构数据库文件
带有 PTM 注释的已枚举候选结构
前体与结构映射元数据