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scikit-bio - 分析生物与微生物组数据

分析生物序列、比对、系统发育树、多样性、排序、生态统计及相关文件格式。

标签

更新于: 2026-09-30
生物信息学序列分析系统发育微生物组生态学多样性分析排序分析生物文件格式

能力

处理生物序列比对生物序列构建系统发育树分析多样性指标

典型输入

生物序列序列比对文件系统发育树

典型输出

分析后的序列数据序列比对结果系统发育树

该技能可以做什么

  • 处理生物序列
  • 比对生物序列
  • 构建系统发育树
  • 分析多样性指标
  • 执行排序分析
  • 运行生态统计检验
  • 读取生物文件格式
  • 写入生物文件格式
  • 转换生物数据格式
  • 分析距离矩阵

输入

  • 生物序列
  • 序列比对文件
  • 系统发育树
  • 计数矩阵
  • 距离矩阵
  • 环境变量
  • 样本分组
  • 生物数据元信息
  • 生物数据文件

输出

  • 分析后的序列数据
  • 序列比对结果
  • 系统发育树
  • 多样性指标
  • 排序结果
  • 统计检验结果
  • 距离矩阵
  • 转换后的生物文件
  • 分析消息

要求

  • Python 环境
  • scikit-bio 库

来源

  • 规范: SKILL.md

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